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      全轉錄組高通量測序,采用去核糖體鏈特異性建庫方法和小片段富集篩選建庫方法,可實現編碼RNA和非編碼RNA的建庫、測序、信息分析及聯合分析、ceRNA等,從而快速全面準確地獲得與特定生物學過程 (例如發(fā)育、疾病等)所有RNA轉錄本數據信息,通過數據分析將生物調控機制研究延伸到“ 網、多層面”結合的立體模式,有助于相對全面解讀生物學現象。


技術路線



分析內容展示


案例解讀

研究背景

植物的雄性不育性包括基因雄性不育(GMS)和細胞質雄性不育(CMS)。在以往的研究中,CirRNA作為內源非編碼RNA,被認為具有miRNA海綿和競爭性內源RNA功能。關于CirRNA在雄性不育和花藥發(fā)育中研究較少,有研究表明環(huán)狀RNA可能在調控花和花粉發(fā)育中發(fā)揮作用。但研究中未建立circRNA-miRNA-mRNA網絡,關于三者在雄性生殖發(fā)育中的相互作用尚需進一步研究。


研究結論

通過全轉錄組測序,揭示了油菜花藥發(fā)育中新的circRNA-miRNA-mRNA調控網絡,加深了對花藥發(fā)育及雄性不育的理解,為進一步研究CirRNA和mRNA在花藥發(fā)育中的功能提供了一定的基礎。


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