科研服務(wù)

      全基因組重測(cè)序是對(duì)已知基因組序列的物種進(jìn)行DNA測(cè)序,并在此基礎(chǔ)上完成個(gè)體或群體分析。全基因組重測(cè)序通過序列比對(duì),可以檢測(cè)到大量變異信息,包括單核苷酸多態(tài)性(SNP)、插入缺失(InDel)、結(jié)構(gòu)變異(SV)和拷貝數(shù)變異(CNV)等?;跈z測(cè)到的變異能進(jìn)一步研究動(dòng)植物的物種特性、群體進(jìn)化問題、定位目標(biāo)性狀基因位點(diǎn)。

      隨著測(cè)序成本降低和已知基因組序列物種的增多,全基因組重測(cè)序已經(jīng)成為動(dòng)植物分子育種、群體進(jìn)化中最為迅速有效的方法之一。利用全基因組重測(cè)序技術(shù)有助于快速發(fā)現(xiàn)與動(dòng)植物重要性狀相關(guān)的遺傳變異,應(yīng)用于分子育種中,縮短育種周期。


技術(shù)路線



產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)

  • 技術(shù)簡(jiǎn)單,穩(wěn)定性好。
  • 檢測(cè)變異類型豐富:可以檢測(cè)SNP、InDel、SV和CNV等多種變異類型,并可用作分子標(biāo)記。
  • 高密度標(biāo)記: 能夠檢測(cè)到全基因組范圍的SNP信息,同時(shí)可檢測(cè)低頻SNP。
  • 發(fā)現(xiàn)新的變異:與芯片方法相比較,可以檢測(cè)到新的變異序列。
  • 高性價(jià)比:與全基因組從頭測(cè)序相比,耗時(shí)更短,成本更低。


分析內(nèi)容展示


案例解讀

結(jié)合多學(xué)科研究,明確了栽培桃起源于我國(guó)西南部的歷史,揭示了桃及其野生近緣種的演化與青藏高原隆升及地形環(huán)境變化密不可分。通過全基因組CNV和SNP變異,分析篩選基因組強(qiáng)選擇區(qū)域及可食用性相關(guān)基因,闡明了果實(shí)大小和果皮顏色性狀的階段性演化歷史。


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