科研服務

      細菌/真菌全基因組測序,是指基于第二代高通量測序和第三代單分子實時測序技術,對細菌/真菌全基因組進行測序,利用生物信息分析手段,得到細菌/真菌的全基因組序列,解析編碼信息和表觀遺傳修飾信息,并獲得相應的變異信息。依據實驗目的和待測樣本與參考基因的序列相似性,可分為細菌/真菌全基因組(近)完成圖測序、框架圖測序和全基因組重測序。

      細菌/真菌全基因組測序,可在致病性、耐藥性、環(huán)境適應性、代謝途徑等多角度進行功能基因的深入挖掘,對微生物不同的表型等特性進行深層次研究。


服務優(yōu)勢

  • 經驗豐富,完成微生物基因組項目10000+。
  • 多測序平臺,提供多種測序方案。
  • 專業(yè)的售后服務體系,經驗豐富的微生物數據挖掘團隊,省時、省心、省力。


技術路線



分析內容展示


案例解讀

研究背景

生物解毒技術已經發(fā)展成熟,利用微生物如細菌、酵母和真菌來消除霉菌毒素污染。 然而,由于缺乏相關酶的分子細節(jié),許多真菌毒素解毒的潛在機制仍不清楚。下一代測序技術提供了能夠降解真菌毒素的微生物的大量基因組數據,使得利用生物信息學技術研究相關酶的分子細節(jié)成為可能。


研究結論

本研究進行了Apiotrichum mycotoxinivorans的全基因組測序,通過生物信息學分析得到了推定的Baeyer-Villiger單加氧酶(BVMOs)和用于玉米赤霉烯酮(ZEA)降解的羧基酯水解酶。 我們開發(fā)了第一個用于底物特異性酶的基因組規(guī)模預測的流程,可建立同源的結構和分子對接模型來展示相關的降解酶作用。本研究中開發(fā)的酶預測工作流程處理GPSE,可能有助于加速新解毒酶的發(fā)現。


(具體細節(jié)請咨詢我司技術人員)

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