科研服務(wù)

      細(xì)菌/真菌全基因組測(cè)序，是指基于第二代高通量測(cè)序和第三代單分子實(shí)時(shí)測(cè)序技術(shù)，對(duì)細(xì)菌/真菌全基因組進(jìn)行測(cè)序，利用生物信息分析手段，得到細(xì)菌/真菌的全基因組序列，解析編碼信息和表觀遺傳修飾信息，并獲得相應(yīng)的變異信息。依據(jù)實(shí)驗(yàn)?zāi)康暮痛郎y(cè)樣本與參考基因的序列相似性，可分為細(xì)菌/真菌全基因組（近）完成圖測(cè)序、框架圖測(cè)序和全基因組重測(cè)序。

      細(xì)菌/真菌全基因組測(cè)序，可在致病性、耐藥性、環(huán)境適應(yīng)性、代謝途徑等多角度進(jìn)行功能基因的深入挖掘，對(duì)微生物不同的表型等特性進(jìn)行深層次研究。


服務(wù)優(yōu)勢(shì)

  • 經(jīng)驗(yàn)豐富，完成微生物基因組項(xiàng)目10000+。
  • 多測(cè)序平臺(tái)，提供多種測(cè)序方案。
  • 專(zhuān)業(yè)的售后服務(wù)體系，經(jīng)驗(yàn)豐富的微生物數(shù)據(jù)挖掘團(tuán)隊(duì)，省時(shí)、省心、省力。


技術(shù)路線



分析內(nèi)容展示


案例解讀

研究背景

生物解毒技術(shù)已經(jīng)發(fā)展成熟，利用微生物如細(xì)菌、酵母和真菌來(lái)消除霉菌毒素污染。 然而，由于缺乏相關(guān)酶的分子細(xì)節(jié)，許多真菌毒素解毒的潛在機(jī)制仍不清楚。下一代測(cè)序技術(shù)提供了能夠降解真菌毒素的微生物的大量基因組數(shù)據(jù)，使得利用生物信息學(xué)技術(shù)研究相關(guān)酶的分子細(xì)節(jié)成為可能。


研究結(jié)論

本研究進(jìn)行了Apiotrichum mycotoxinivorans的全基因組測(cè)序，通過(guò)生物信息學(xué)分析得到了推定的Baeyer-Villiger單加氧酶（BVMOs）和用于玉米赤霉烯酮（ZEA）降解的羧基酯水解酶。 我們開(kāi)發(fā)了第一個(gè)用于底物特異性酶的基因組規(guī)模預(yù)測(cè)的流程，可建立同源的結(jié)構(gòu)和分子對(duì)接模型來(lái)展示相關(guān)的降解酶作用。本研究中開(kāi)發(fā)的酶預(yù)測(cè)工作流程處理GPSE，可能有助于加速新解毒酶的發(fā)現(xiàn)。


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