科研服務(wù)

      DNA甲基化對(duì)生命活動(dòng)非常重要,是基因調(diào)控的手段之一(即通過對(duì)位于啟動(dòng)子及第一外顯子區(qū)的CpG島的甲基化而抑制基因表達(dá)的表達(dá)),它在基因表達(dá)調(diào)控、腫瘤研究、染色質(zhì)重塑、遺傳印記、疾病研究、胚胎發(fā)育、環(huán)境與表觀遺傳和表觀異質(zhì)性等方面起至關(guān)重要的作用,是表現(xiàn)遺傳學(xué)研究的熱點(diǎn)。


方案設(shè)計(jì)

      全基因組甲基化實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)思路為差異比較,常見的類型為實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組,進(jìn)行兩兩比較。通過重亞硫酸鹽對(duì)基因組DNA進(jìn)行處理,將未甲基化的C堿基轉(zhuǎn)化為U堿基,而甲基化的C則不會(huì)改變,進(jìn)行PCR擴(kuò)增后U堿基會(huì)變成T,與原本具有甲基化修飾的C堿基區(qū)分開來。WGBS精密度高,可以精確得到單個(gè)堿基,獲得單堿基精度生物甲基化圖譜。建議設(shè)置3-6個(gè)生物學(xué)重復(fù),以減少組內(nèi)誤差并增強(qiáng)結(jié)果的可靠性。


技術(shù)路線



分析內(nèi)容


分析內(nèi)容展示


案例解析

通過對(duì)產(chǎn)蛋前期和高峰期雞肝全基因組甲基化差異進(jìn)行分析,解析基因組甲基化對(duì)不同發(fā)育階段肝中基因表達(dá)差異的影響。本研究繪制了不同生理時(shí)期盧氏綠殼蛋雞全基因組甲基化圖譜,結(jié)合mRNA轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)闡述了DNA甲基化在基因表達(dá)方面的調(diào)控作用,并鑒定出了不同生理時(shí)期受甲基化調(diào)控的基因,為深入研究表觀遺傳調(diào)控在不同生理時(shí)期蛋雞肝代謝中的作用機(jī)制提供參考。


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