科研服務

      DNA甲基化對生命活動非常重要,是基因調控的手段之一(即通過對位于啟動子及第一外顯子區(qū)的CpG島的甲基化而抑制基因表達的表達),它在基因表達調控、腫瘤研究、染色質重塑、遺傳印記、疾病研究、胚胎發(fā)育、環(huán)境與表觀遺傳和表觀異質性等方面起至關重要的作用,是表現(xiàn)遺傳學研究的熱點。


方案設計

      全基因組甲基化實驗設計思路為差異比較,常見的類型為實驗組與對照組,進行兩兩比較。通過重亞硫酸鹽對基因組DNA進行處理,將未甲基化的C堿基轉化為U堿基,而甲基化的C則不會改變,進行PCR擴增后U堿基會變成T,與原本具有甲基化修飾的C堿基區(qū)分開來。WGBS精密度高,可以精確得到單個堿基,獲得單堿基精度生物甲基化圖譜。建議設置3-6個生物學重復,以減少組內誤差并增強結果的可靠性。


技術路線



分析內容


分析內容展示


案例解析

通過對產蛋前期和高峰期雞肝全基因組甲基化差異進行分析,解析基因組甲基化對不同發(fā)育階段肝中基因表達差異的影響。本研究繪制了不同生理時期盧氏綠殼蛋雞全基因組甲基化圖譜,結合mRNA轉錄組數(shù)據(jù)闡述了DNA甲基化在基因表達方面的調控作用,并鑒定出了不同生理時期受甲基化調控的基因,為深入研究表觀遺傳調控在不同生理時期蛋雞肝代謝中的作用機制提供參考。


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