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     單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序（Single cell RNA sequencing，scRNA-seq）是在單細(xì)胞水平進(jìn)行高通量基因表達(dá)譜檢測(cè)，通過(guò)對(duì)大量的單細(xì)胞基因表達(dá)數(shù)據(jù)進(jìn)行細(xì)胞表達(dá)特征聚類(lèi)、亞群表達(dá)特征分析、標(biāo)志物篩選等，能夠?qū)?fù)雜細(xì)胞群深入分析，避免單個(gè)細(xì)胞的異質(zhì)性生物學(xué)信息被大量喜歡的均質(zhì)化覆蓋，在生殖、免疫、干細(xì)胞分化、腫瘤異質(zhì)性、神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育及腦發(fā)育等研究領(lǐng)域中有著廣泛的應(yīng)用。



分析路線(xiàn)



分析內(nèi)容展示


案例解析

研究背景

單細(xì)胞基因表達(dá)研究報(bào)道，到目前為止，植物的文章發(fā)表有限，盡管人們已經(jīng)認(rèn)識(shí)到植物中大規(guī)模單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組研究的潛在益處，本文基于10X Genomics chromium平臺(tái)，分析了擬南芥根部約10,000個(gè)細(xì)胞（原生質(zhì)體）的轉(zhuǎn)錄組數(shù)。

研究結(jié)論

基于10X Genomics chromium 平臺(tái)，分析了擬南芥根部約10,000個(gè)細(xì)胞（原生質(zhì)體）的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，從中發(fā)現(xiàn)了主要的組織類(lèi)型以及發(fā)育不同階段的細(xì)胞，此外還鑒定出較為稀有的細(xì)胞亞群；在此基礎(chǔ)上，該研究重點(diǎn)分析了根部表皮細(xì)胞，基于擬時(shí)分析展示了分生組織發(fā)育過(guò)程中 hair 細(xì)胞與 non-hair細(xì)胞的分化軌跡。


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