
科研服務(wù)
質(zhì)粒DNA作為基因遞送的非病毒載體,在傳染性疾病預(yù)防性疫苗、腫瘤治療、蛋白替代治療等領(lǐng)域有著廣泛應(yīng)用。但治療性質(zhì)粒DNA亦面臨一些難題,如質(zhì)粒DNA存在整合到靶標(biāo)細(xì)胞基因組上的風(fēng)險;質(zhì)粒DNA序列上存在的CpG基序可能具有免疫刺激效應(yīng); 存在于人體中的細(xì)菌可能會發(fā)生質(zhì)粒轉(zhuǎn)化,導(dǎo)致質(zhì)粒DNA復(fù)制,從而使體內(nèi)細(xì)菌產(chǎn)生耐藥性;此外,用限制性內(nèi)切酶切割或PCR擴(kuò)增獲得的僅含有轉(zhuǎn)錄單位的DNA片段,遇到核酸外切酶極易發(fā)生降解。
LC-dsDNA(Linear, covalent closed, double strand DNA),即線性共價閉合雙鏈DNA,在兩端具有自由的、非連接的3' 和5'末端,是一種小的、線性雙鏈共價閉合DNA 結(jié)構(gòu)。LC-dsDNA不攜帶骨架信息,僅表達(dá)目的基因,分子量小,細(xì)胞轉(zhuǎn)染效率高; 且在抗原的表達(dá)及小鼠體內(nèi)能夠觸發(fā)的體液免疫和細(xì)胞免疫的水平媲美質(zhì)粒DNA疫苗達(dá)到的效果,可以提供有效的抵抗病毒感染的保護(hù)效力。將 LC-dsDNA 導(dǎo)入目標(biāo)細(xì)胞中,可實現(xiàn)對細(xì)胞內(nèi)特定基因的引入和表達(dá),在臨床應(yīng)用及安全性上有較大優(yōu)勢。
與傳統(tǒng)DNA質(zhì)粒相比,LC-dsDNA具有以下優(yōu)勢:
- 1)剔除質(zhì)粒骨架及無關(guān)外源序列,降低風(fēng)險,安全性更高;
- 2)降低CpG基序,降低觸發(fā)免疫反應(yīng)的風(fēng)險;
- 3)不受質(zhì)粒骨架拷貝數(shù)影響,產(chǎn)量更高;
- 4)在哺乳動物體內(nèi)表達(dá)更好,每次轉(zhuǎn)染所需DNA量更少。
與PCR擴(kuò)增或酶切獲得的DNA片段相比,LC-dsDNA 3’末端自身環(huán)化,形成共價閉合結(jié)構(gòu),免受核酸外切酶攻擊,穩(wěn)定性更高。
通用生物擁有專業(yè)的基因及質(zhì)粒生產(chǎn)、工藝開發(fā)團(tuán)隊,在科研級LC-dsDNA定制合成方面具有豐富的經(jīng)驗,可提供從基因合成、質(zhì)粒制備、LC-dsDNA合成一站式服務(wù)。 可合成制備200-8000 bp LC-dsDNA ,并可針對不同的下游應(yīng)用進(jìn)行優(yōu)化定制。交付的產(chǎn)品具有高產(chǎn)量、高純度、低雜質(zhì)殘留等特點,可應(yīng)用于核酸(DNA、mRNA)疫苗及藥物研發(fā)、細(xì)胞與基因治療(GCT)等諸多領(lǐng)域的早期研究階段。
服務(wù)內(nèi)容
服務(wù)步驟 | 服務(wù)內(nèi)容 | 周期 | 交付內(nèi)容 |
---|---|---|---|
1.基因合成及質(zhì)粒制備 | 基因合成、質(zhì)粒構(gòu)建 | 1-2周 |
a) LC-dsDNA產(chǎn)品 b) COA 文件 c) 序列驗證文件 |
質(zhì)粒抽提 | |||
2.LC-dsDNA合成 | 體內(nèi)或體外合成 | 3-4周 | |
純化回收 | |||
3.質(zhì)控 | 默認(rèn)QC+額外QC項(可定制) | 詳詢 |
QC項目
QC | 項目 | 檢測方法 |
---|---|---|
默認(rèn) | 外觀 | 目測 |
LC-dsDNA產(chǎn)品序列完整度 | 瓊脂糖凝膠電泳 | |
序列準(zhǔn)確性 | DNA模板Sanger 測序 | |
LC-dsDNA DNA濃度 | Nano drop定量 | |
A260/280 | Nano drop定量 | |
內(nèi)毒素含量 | 凝膠鱟試劑法 | |
生物負(fù)載 | TSA 48h平板檢測 | |
額外(可選)* | 模板DNA殘留 | qPCR |
蛋白殘留 | ELISA法;BCA蛋白定量;Qubit法(可選) | |
DNA酶殘留 | DNase檢測 | |
純度 | CE/HPLC |
服務(wù)應(yīng)用
1)mRNA IVT 的模板
以LC-dsDNA為mRNA體外合成模板,細(xì)菌質(zhì)粒殘留是傳統(tǒng)方法的1/100以下。通用生物可提供70-150 polyA模板的快速合成服務(wù)。
2)基因編輯
LC-dsDNA可作為CRISPR/Cas基因編輯技術(shù)中基因敲入的HDR模板。線性閉合末端結(jié)構(gòu),免受細(xì)胞內(nèi)核酸外切酶攻擊,提高編輯效率,同時閉合結(jié)構(gòu)降低非同源末端連接的風(fēng)險。
3)基因治療非病毒載體
作為基因遞送的非病毒載體,LC-dsDNA具有更高的載量,更大的轉(zhuǎn)基因能力,毒性低,免疫原性反應(yīng)小,安全性更高。
案例展示
LC-dsDNA合成
![]() 圖a.大腸桿菌體內(nèi)誘導(dǎo)合成LC-dsDNA瓊脂糖凝膠電泳檢測 |
![]() 圖b. LC-dsDNA純化后凝膠電泳 |
注. 圖a. 1、2為誘導(dǎo)前質(zhì)粒DNA凝膠電泳檢測;3、4、5、6為誘導(dǎo)后DNA凝膠電泳檢測
注. 圖b. 7、8、9、10為4個樣本純化后凝膠電泳檢測.
LC-dsDNA純度檢測
![]() 圖c. Agilent 5200 分析儀檢測LC-dsDNA純度 |
Agilent 5200 分析儀檢測純度達(dá)96.8%。
細(xì)胞轉(zhuǎn)染鑒定
![]() LC-dsDNA EGFP轉(zhuǎn)染24h |
![]() mRNA-EGFP 轉(zhuǎn)染24h |
經(jīng)轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞表達(dá)鑒定,LC-dsDNA EGFP表達(dá)水平與mRNA-EGFP相近,均實現(xiàn)高表達(dá)
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