科研服務(wù)

      宏基因組學(xué)（Metagenomics），又稱元基因組學(xué)，是以特定生境中的整個微生物群落作為研究對象，無需分離培養(yǎng)， 直接提取環(huán)境樣本DNA進(jìn)行測序，研究環(huán)境微生物的群落結(jié)構(gòu)、物種分類、系統(tǒng)進(jìn)化、基因功能及代謝網(wǎng)絡(luò)等，已廣泛應(yīng)用于微生物領(lǐng)域。


產(chǎn)品特點(diǎn)

  • 直接對群落樣本中的基因片段進(jìn)行測序，真實(shí)再現(xiàn)群落復(fù)雜而精密的生態(tài)功能；
  • 樣本類型涵蓋廣，微量提取成功率高；
  • 使用Illumina NovaSeq超高通量測序平臺，速度更快周期更短；
  • 功能+物種，雙管齊下；拼接+不拼接，各取所長，真正實(shí)現(xiàn)對物種和功能的“高分辨率”精確定量；
  • 根據(jù)樣本、數(shù)據(jù)特征，自動選擇最佳分析流程，多種功能注釋數(shù)據(jù)庫可選，最優(yōu)化宏基因組功能代謝譜注釋；
  • 通過多種多變量統(tǒng)計分析和機(jī)器學(xué)習(xí)方法，系統(tǒng)深入地挖掘宏基因組大數(shù)據(jù)種差異相關(guān)的關(guān)鍵物種和關(guān)鍵功能，精確識別關(guān)鍵生物標(biāo)記物。


技術(shù)路線



分析內(nèi)容展示


案例解讀

研究背景

隨著工業(yè)化和城市化進(jìn)程的推進(jìn)，多環(huán)芳烴類污染物在水體沉積物中頻繁檢出，給水生態(tài)安全和人類健康造成極大威脅。 本研究通過結(jié)合梯度稀釋培養(yǎng)法、傳統(tǒng)的分離培養(yǎng)技術(shù)以及宏基因組生物學(xué)分析等多種方法手段，深入解析了黑臭河流沉積物中硫酸鹽呼吸耦合多環(huán)芳烴降解的核心功能微生物組。


研究結(jié)論

梯度稀釋培養(yǎng)法在顯著降低沉積物中微生物群落復(fù)雜，同時并未削弱菌群的多環(huán)芳烴降解功能。Desulfovibrio和Petrimonas是硫酸鹽呼吸耦合多環(huán)芳烴降解的核心功能微生物。 這兩種微生物通過潛在的協(xié)同作用促進(jìn)多環(huán)芳烴降解轉(zhuǎn)化。其中，Desulfovibrio主要負(fù)責(zé)通過羧化途徑將多環(huán)芳烴降解至六氫-2-萘甲酰，而Petrimonas則利用其相對完整的三羧酸循環(huán)途徑和磷酸戊糖途徑實(shí)現(xiàn)前者多環(huán)芳烴中間代謝產(chǎn)物的進(jìn)一步降解轉(zhuǎn)化。


（具體細(xì)節(jié)請咨詢我司技術(shù)人員）

訂購信息

下載產(chǎn)品訂購表或產(chǎn)品訂購合同并按要求填寫后發(fā)送至 ngs-service@generalbiol.com ，公司收到訂單或產(chǎn)品訂購合同會及時與您回復(fù)及確認(rèn)，并安排相關(guān)人員生產(chǎn)發(fā)貨。

  • 訂單或合同下載 為保證您的訂單或訂購合同順利上傳，請您下載最新訂單或訂購合同。
  • 郵箱： ngs-service@generalbiol.com
  • 電話： 0550-3121666轉(zhuǎn)8866