科研服務(wù)

      miRNA測序是通過檢測已知和未知miRNA的表達水平及其表達差異，結(jié)合同一樣本的轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)進行聯(lián)合分析，可以同時分析miRNA及其靶基因的表達情況，為研究RNA的功能及調(diào)控機制提供有力的工具。


作用機制

  • 翻譯抑制：miRNA與靶mRNA通過6-7個堿基互補結(jié)合（部分互補），可導致miRNA在蛋白質(zhì)翻譯水平上抑制靶基因表達（哺乳動物中比較普遍）。
  • mRNA的降解：miRNA也有可能影響mRNA的穩(wěn)定性。如果miRNA與靶位點完全互補（或者幾乎完全互補）， 那么這些miRNA的結(jié)合往往會引起靶mRNA的降解(在植物中比較常見)。
  • 轉(zhuǎn)錄調(diào)控：表觀遺傳是指在核酸序列水平上不涉及基因組改變的遺傳變化。miRNA影響基因啟動子的CpG 島甲基化作用，在轉(zhuǎn)錄水平直接對靶基因進行調(diào)控作用。
  • 聯(lián)合分析：可以與多種產(chǎn)品進行聯(lián)合分析。包括mRNA+miRNA 、lncRNA+miRNA、circRNA+miRNA+ lncRNA、甲基化+mRNA+miRNA等。


技術(shù)路線



分析內(nèi)容展示


案例解讀

研究背景

蘋果是世界上最重要的經(jīng)濟果樹之一，干旱脅迫抑制蘋果生長，導致葉片過早脫落，果實產(chǎn)量和品質(zhì)下降。SnRNA參與了植物的許多生物學過程，如生長和器官發(fā)育、激素信號通路、營養(yǎng)吸收和調(diào)控以及非生物和生物脅迫反應(yīng)。最近的研究集中在揭示蘋果miRNA在許多生物過程中的作用，如營養(yǎng)階段轉(zhuǎn)變，莖生長、形態(tài)發(fā)生和生物應(yīng)激反應(yīng)。然而對干旱脅迫下蘋果miRNA的響應(yīng)模式和調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的研究還很少。


研究結(jié)論

在本研究中，通過小RNA測序分析來鑒定野生蘋果中的snRNA及其靶標基因，鑒定得到210個已知miRNA和125個候選miRNAs。研究干旱脅迫下這些snRNA和靶基因的表達模式?；诠δ茏⑨尯透患Y(jié)果得出結(jié)論，miR171i-SCL26.1模塊通過調(diào)節(jié)抗氧化基因表達和抗壞血酸代謝來提高抗旱性，snRNA在干旱脅迫的早期能夠快速響應(yīng)環(huán)境刺激并調(diào)節(jié)基因表達。


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