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     單細胞轉(zhuǎn)錄組測序（Single cell RNA sequencing，scRNA-seq）是在單細胞水平進行高通量基因表達譜檢測，通過對大量的單細胞基因表達數(shù)據(jù)進行細胞表達特征聚類、亞群表達特征分析、標志物篩選等，能夠?qū)碗s細胞群深入分析，避免單個細胞的異質(zhì)性生物學信息被大量喜歡的均質(zhì)化覆蓋，在生殖、免疫、干細胞分化、腫瘤異質(zhì)性、神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育及腦發(fā)育等研究領域中有著廣泛的應用。



分析路線



分析內(nèi)容展示


案例解析

研究背景

單細胞基因表達研究報道，到目前為止，植物的文章發(fā)表有限，盡管人們已經(jīng)認識到植物中大規(guī)模單細胞轉(zhuǎn)錄組研究的潛在益處，本文基于10X Genomics chromium平臺，分析了擬南芥根部約10,000個細胞（原生質(zhì)體）的轉(zhuǎn)錄組數(shù)。

研究結(jié)論

基于10X Genomics chromium 平臺，分析了擬南芥根部約10,000個細胞（原生質(zhì)體）的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，從中發(fā)現(xiàn)了主要的組織類型以及發(fā)育不同階段的細胞，此外還鑒定出較為稀有的細胞亞群；在此基礎上，該研究重點分析了根部表皮細胞，基于擬時分析展示了分生組織發(fā)育過程中 hair 細胞與 non-hair細胞的分化軌跡。


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