科研服務(wù)

微衛(wèi)星標(biāo)記（Microsatellite）也稱為短串聯(lián)重復(fù)序列（STR）或簡(jiǎn)單重復(fù)序列（SSR），是廣泛分布在真核生物基因組中的簡(jiǎn)單重復(fù)序列，一般由一個(gè)長(zhǎng)2～6bp的核心序列經(jīng)多次串聯(lián)重復(fù)排列而成，重復(fù)次數(shù)大多在10～60次之間。微衛(wèi)星中重復(fù)單位的數(shù)目存在高度變異，這些變異表現(xiàn)為微衛(wèi)星數(shù)目的整倍性變異或重復(fù)單位序列中的序列有可能不完全相同，因而造成多個(gè)位點(diǎn)的多態(tài)性。SSR標(biāo)記能很好地將這些變異揭示出來(lái)，不同的SSR在不同的種甚至不同個(gè)體間的多態(tài)性。由于基因組中某一特定的微衛(wèi)星的側(cè)翼序列通常都是保守性較強(qiáng)的單一序列，因而可以將微衛(wèi)星側(cè)翼的DNA片段克隆、測(cè)序，然后根據(jù)微衛(wèi)星的側(cè)翼序列就可以人工合成引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增，從而將單個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)擴(kuò)增出來(lái)。由于單個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)重復(fù)單元在數(shù)量上的變異，個(gè)體的擴(kuò)增產(chǎn)物在長(zhǎng)度上的變化就產(chǎn)生長(zhǎng)度的多態(tài)性，這一多態(tài)性稱為簡(jiǎn)單序列重復(fù)長(zhǎng)度多態(tài)性(SSLP)，每一擴(kuò)增位點(diǎn)就代表了這一位點(diǎn)的一對(duì)等位基因。由于SSR重復(fù)數(shù)目變化很大，所以SSR標(biāo)記能揭示比RFLP高得多的多態(tài)性。STR分型高效快捷，結(jié)果精確，是非常重要的遺傳標(biāo)記，在基因定位、遺傳育種等領(lǐng)域有著廣泛的應(yīng)用。

產(chǎn)品內(nèi)容

項(xiàng)目類型 STR遺傳標(biāo)記分析服務(wù)價(jià)格
位點(diǎn)調(diào)試費(fèi) 位點(diǎn)檢測(cè)費(fèi)
STR分型 300元/位點(diǎn) 5元/位點(diǎn)/樣本

檢測(cè)技術(shù)

微衛(wèi)星位點(diǎn)通常通過(guò)PCR擴(kuò)增和電泳檢測(cè)，并根據(jù)片段大小分離等位基因進(jìn)行分析；擴(kuò)增后的等位微衛(wèi)星可以用多種方法檢測(cè)，傳統(tǒng)方法采用聚丙烯酰胺凝膠電泳加放射顯影或銀染的方法，費(fèi)時(shí)費(fèi)力效率低。利用ABI遺傳分析儀對(duì)熒光標(biāo)記的DNA片段進(jìn)行檢測(cè)，結(jié)合分子量?jī)?nèi)標(biāo)進(jìn)行DNA片段長(zhǎng)度計(jì)算，使STR分型變得高效快捷，結(jié)果也更加精確?；跍y(cè)序儀平臺(tái)，我公司同時(shí)提供的全套微衛(wèi)星（STR、SSR）分型服務(wù)，包括MSI、LOH分析等。

實(shí)驗(yàn)流程

  • 實(shí)驗(yàn)方案的設(shè)計(jì)，包括熒光標(biāo)記的選擇，引物的設(shè)計(jì)、合成和標(biāo)記、內(nèi)標(biāo)的選用等。
  • 預(yù)實(shí)驗(yàn)：確定PCR反應(yīng)條件。
  • 正式實(shí)驗(yàn)：完成熒光PCR，并在測(cè)序儀上完成電泳掃描，數(shù)據(jù)采集，去掉低值數(shù)據(jù)，分析結(jié)果、補(bǔ)充測(cè)序、完成分析。
  • 對(duì)收集的數(shù)據(jù)進(jìn)行處理分析，提供產(chǎn)物片段大小、數(shù)量多少的信息數(shù)據(jù)。

樣品要求

  • DNA樣品：濃度≥50ng/μl、體積≥20μl的總DNA樣品，DNA抽提：血液20元/樣本；新鮮組織30元/樣本；石蠟包埋組織50元/樣本；
  • 血液樣品：請(qǐng)?zhí)峁?00μl抗凝血；采用標(biāo)準(zhǔn)的采樣管，抗凝劑推薦使用EDTA；
  • 組織樣品：請(qǐng)?zhí)峁┳懔康慕M織樣品（≥300mg）；
  • 細(xì)胞（≥106 ）；
  • STR位點(diǎn)信息： STR位點(diǎn)上下游各200bp的確切序列及STR位點(diǎn)的信息；

提供結(jié)果

  • 實(shí)驗(yàn)過(guò)程及其涉及的電泳圖、測(cè)序峰型圖；
  • 擴(kuò)增和反應(yīng)體系所設(shè)計(jì)的引物序列；
  • 客戶所需的其他資料。

參考資料

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